Het opleidingsinstituut valt onder een aparte stichting, de stichting Opleidingsinstituut IGT (SOIGT), waarin een vaste vertegenwoordiging wordt gevormd door een bestuurslid van de Nederlandse Vereniging voor Tropische Geneeskunde en Internationale Gezondheidszorg (NVTG). 

Bestuursleden SOIGT:
Martin Boeree (voorzitter)
Jogchum Beltman (secretaris)
Hanneke Dekker (namens NVTG-bestuur)
Angelique Veenstra
Edmée Bowles
Michel Farkas

Het instituut werkt nauw samen met het Concilium Internationale Gezondheidszorg en Tropengeneeskunde (CIGT) van de NVTG dat de inhoud van de opleiding borgt.

De Wetenschapsraad, OIGT en NVTG heeft tot taak het wetenschappelijk niveau van de opleiding Internationale Gezondheidszorg en Tropengeneeskunde (IGT) te bewaken. 

De leden van de Wetenschapsraad kunt u hier vinden.

Het opleidingsinstituut onderhoudt nauwe banden met de Nederlandse Vereniging voor Tropische Geneeskunde en Internationale Gezondheidszorg, de NVTG en het Kennis Centrum Global Health, KCGH. Met de NVTG is er een formele relatie, statutair vastgelegd: een vertegenwoordiger uit het NVTG bestuur is ook lid van de Raad van Toezicht van het OIGT. In de figuur geeft de zwarte pijl deze formele relatie weer. Het Concilium van de NVTG adviseert het opleidingsinstituut over de inhoud van de opleiding. De Wetenschapsraad adviseert over de wetenschappelijke borging van de opleiding en het beoefenen van wetenschap tijdens de opleiding.   
De Registratiecommissie Geneeskundig Specialisten geeft erkenning van de opleiding af. Hiervoor moet het OIGT voldoen aan alle eisen die gesteld worden aan alle medisch specialistische opleidingen.